Докторантура Київського національного торговельно-економічного університету відкрита з 1994 р. 

Університет здійснює підготовку здобувачів ступеня доктора наук за наступними спеціальностями:
033 Філософія
051 Економіка
053 Психологія
071 Облік і оподаткування
072 Фінанси, банківська справа, страхування та фондовий ринок
073 Менеджмент
075 Маркетинг
076 Підприємництво та торгівля
081 Право
181 Харчові технології
292 Міжнародні економічні відносини