Докторантура Київського національного торговельно-економічного університету відкрита з 1994 р. 

Університет здійснює підготовку здобувачів ступеня доктора наук за наступними спеціальностями:

05.18.08  Товарознавство непродовольчих товарів

05.18.15  Товарознавство харчових продуктів

05.18.16  Технологія харчової продукції

08.00.01  Економічна теорія та історія економічної думки

08.00.02  Світове господарство і міжнародні економічні відносини

08.00.03  Економіка та управління національним господарством 

08.00.04  Економіка та управління підприємствами (за видами економічної діяльності)

08.00.08  Гроші, фінанси і кредит

08.00.09  Бухгалтерський облік, аналіз та аудит (за видами економічної діяльності)

09.00.03  Соціальна філософія та філософія історії

12.00.07  Адміністративне право і процес; фінансове право; інформаційне право

19.00.10  Організаційна психологія, економічна психологія